Слово духами может употребляться в 2-х разных значениях:
I. ду́хами — творительный падеж, множественное число слова дух (в обычных знач.)
В слове «духами» ударение падает на слог с буквой У — дУхами.
II. духа́ми — творительный падеж, множественное число слова духи
В слове «духами» ударение падает на слог с буквой А — духАми.