Слово глуби может употребляться в 2-х разных значениях:
I. глу́би — родительный падеж слова глубь
В таком варианте ударение следует ставить на слог с буквой У — глУби.
II. глуби́ — местный (второй предложный) падеж слова глубь
В указанном выше варианте ударение падает на слог с буквой И — глубИ.