Слово главком может употребляться в 2-х разных значениях:
I. гла́вком — творительный падеж слова главк
В слове «главком» ударение падает на слог с буквой А — глАвком.
II. главко́м — существительное
В таком варианте ударение следует ставить на слог с буквой О — главкОм.